在汉末三国时期，州牧和刺史都是地方行政官员，但他们的权力大小有所不同。州牧是州级最高行政官员，负责一州的行政、军事、司法等事务，权力相对较大。而刺史则是监察官员，主要负责监督州牧等地方官员的行为，权力相对较小。从权力大小的角度来看，州牧的权力要大于刺史。

州牧，又称州牧制，是汉末三国时期的一种地方行政制度，州牧的职责是管理一州之内的行政、军事、文化等事务，在州牧制度下，州牧成为一州之内的最高行政长官，负责处理各种政务，包括治理百姓、征收赋税、维护治安等，州牧还负责选拔和推荐人才，以及参与中央政府的决策和议事。

刺史，又称刺史制，也是汉末三国时期的一种地方行政制度，刺史的职责是监督和管理一州之内的行政、军事等事务，在刺史制度下，刺史成为一州之内的最高监察官员，负责对地方官员的监察和监督，防止他们滥用职权、贪污腐败等行为，刺史还负责审理案件、维护司法公正等事务。

从上述职责可以看出，州牧和刺史在汉末三国时期的权力确实存在明显的差异，州牧作为一州之内的最高行政长官，负责处理各种政务，其权力相对较大；而刺史则作为一州之内的最高监察官员，主要负责对地方官员的监察和监督，其权力相对较小，可以说在汉末三国时期，州牧的权力大于刺史。

州牧和刺史的职位设置对汉末三国时期的政治生态产生了深远的影响，州牧作为一州之内的最高行政长官，其权力过大可能导致地方官员滥用职权、贪污腐败等行为，甚至可能形成地方割据势力，对中央政府的统一和稳定造成威胁，刺史作为一州之内的最高监察官员，其权力相对较小，可能导致其对地方官员的监察和监督力度不够，甚至可能被地方官员所收买或排挤。

州牧和刺史在汉末三国时期的权力确实存在差异，这两种职位的设置对汉末三国时期的政治生态产生了深远的影响，在探讨汉末三国时期的历史问题时，我们需要全面考虑各种因素的作用和影响。